平方根にも同じ圧縮を行う。偶奇の箱より平方根の数が多いので、二つは同じパターンに入る。
各平方積の組について xjyj=sj2x_jy_j=s_j^2xjyj=sj2 と書く。平方根 sjs_jsj を素因子指数の偶奇ベクトルで分類する。類は再び 292^929 個しかないのに、平方根は 29+12^9+129+1 個あるので、例えば sp,sqs_p,s_qsp,sq が同じ類になる二つがある。したがって spsqs_ps_qspsq は平方数、すなわち u2u^2u2 である。